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菊粉是植物中儲備性多糖，主要來源于植物，已發現有36000多種，包括雙子葉植物中的菊科、桔梗科、龍膽科等11個科及單子葉植物中的百合科、禾木科。例如，在菊芋、菊苣的塊莖、天竺牡丹（大理菊）的塊根、薊的根中都含有豐富的菊粉其中新糖源菊粉含量是的。

菊粉分子約由31個β-D-呋喃果糖和1~2個吡喃菊糖殘基聚合而成，果糖殘基之間能通過β-2，1-鍵連接。是由D-果糖經β（1→2）糖苷鍵鏈接而成的線性直鏈多糖，末端常帶有一個葡萄糖殘基，聚合度（DP）為2~60，其中平均聚合度DP≤9的菊粉又稱為短鏈菊粉，從天然植物中提取的菊粉同時含有長鏈與短鏈。菊粉的分子式表示為GFn，其中G代表終端葡萄糖單位，F代表果糖分子，n代表果糖的單位數。